OBJECTIFS • Actualisation des connaissances en Microbiota. PROGRAMME 1. Les microbiotes : composition des flores et leurs métabolismes, implantation des microbiotes, impact de l’alimentation Après un rappel sur la composition des principales flores bactériennes, l’implantation progressive des différents phyla bactériens sera décrite. Un accent sera mis sur le microbiote intestinal et son implication dans certaines pathologies digestives (rôle de l’alimentation et des acides gras à courte chaine), l’influence des xénobiotiques, ainsi que son lien avec d’autres maladies systémiques (pathologies neurologiques, asthme…). 2. Méthodes d’études des microbiotes, leurs avantages et leurs limites (métagénomique, métabolomique) De nouvelles technologies de séquençage dites « à haut débit » ont massivement accéléré la vitesse de séquençage et ont simultanément réduit son coût. Il sera discuté des avantages et limites des différentes méthodes, pouvant influer sur l’interprétation de la description qualitative et quantitative des microbiotes. 3. Les fonctions des microbiotes (trophiques, métaboliques, de défense/barrière…) – Dysbiose. Exemple de la mucoviscidose Les résultats des études des microbiotes pulmonaires ont changé la vision conventionnelle de la mucoviscidose, qui a traditionnellement étudié une série limitée de bactéries pathogènes opportunistes. Les voies aériennes hébergent généralement des communautés microbiennes complexes qui seront analysées, et des changements dans la structure et l'activité de ces communautés peuvent influer sur l'état clinique du patient et la progression de la maladie pulmonaire. 4. Microbiotes et pathologies : microbiotes et maladies rhumatismales Les maladies rhumatismales sont la conséquence d’anomalies génétiques et de l’intervention de facteurs environnementaux. L’étude de la participation du microbiome dans la pathogenèse de ces maladies et l’exploration des mécanismes potentiels par lesquels ils peuvent influencer sur le développement de l'auto-immunité seront discutés. 5. Transplantation fécale La transplantation de la microflore fécale consiste à introduire une préparation constituée d'une dilution des selles d'un donneur sain dans le tube digestif d'un patient, face à une dysbiose intestinale ou une colonisation excessive (Clostridium difficile). La transplantation de microbiotes fécaux bénéficie aujourd’hui d’un niveau élevé de preuves cliniques et, en France, elle répond à la définition d'un médicament, devant certifier de critères précis de méthodes de préparations, dans un cadre législatif qui sera précisé. METHODE D’EVALUATION La méthode retenue est un test sous la forme d’un QCM d’une dizaine de questions avant la formation. Ce même test est de nouveau effectué par les stagiaires à la fin de la formation. La correction et la restitution des résultats aux professionnels de santé seront transmis ultérieurement.