L’infection urinaire est la deuxième infection communautaire la plus fréquente après les infections des voies respiratoires. C’est la première cause d’infection liée aux soins en milieu hospitalier. Les entérobactéries sont les principales pourvoyeuses d’infections urinaires. E. coli est de loin la première bactérie responsable d’infection urinaire. Elle est retrouvée dans 70-95 % des cas d’infections communautaires et 30-50 % des cas d’infections nosocomiales. Les autres entérobactéries représentent 10-25 % des infections urinaires, particulièrement Proteus spp. et Klebsiella spp. Staphylococcus saprophyticus est presque exclusivement responsable de cystites, où il représente 1 à 7 % des cas en France selon les études, principalement chez les femmes jeunes. La résistance aux antibiotiques en ville est illustrée dans Géodes par la résistance aux céphalosporines de 3e génération (C3G), aux fuoroquinolones (FQ) et la présence de bêta-lactamases à spectre étendu (BLSE), principal mécanisme de résistance aux C3G, chez les bactéries E. coli isolées de prélèvements urinaires. L’expansion de l’antibiorésistance constitue un problème prioritaire de santé publique au niveau national et international. L’European Center for Disease Prevention and Control (ECDC) et l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) ont inclus la résistance bactérienne dans leurs priorités (réf. Plan national d’alerte sur les antibiotiques 2011-2016 - Ministère chargé de la santé). Le biologiste est un acteur clé dans le bon usage des antibiotiques et doit être capable de : ‒ sensibiliser les prescripteurs au bon usage des antibiotiques, en particulier au risque que présente la prescription de certains antibiotiques en termes de résistances bactériennes avec comme corollaire la réduction de la consommation d’antibiotiques critiques ; ‒ favoriser la prescription des antibiotiques les plus adaptés, à spectre étroit ou à faible risque de sélection de résistances ; ‒ favoriser les prescriptions conformément aux recommandations ;